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LEPSE

M3P

 

Le LEPSE, classé dans le top 5% des laboratoires de recherche en écophysiologie au niveau mondial en 2014 par un panel d'experts, développe depuis prés de 15 ans des plateformes de phénotypage à haut-débit (500 à 1500 plantes simultanément). Ces plateformes sont utilisées au service de l'analyse et de la modélisation de la variabilité génétique de la réponse des plantes aux stress environnementaux et aux changements climatiques (sécheresse, hautes températures notamment). Elles reçoivent de grandes collections de génotype d'une même espèce pour évaluer leur degré de tolérance et obtenir des caractéristiques qui sont ensuite injectées dans des modèles prédictifs permettant de sélectionner les variétés du futur. 

Ces plateformes sont regroupées aujourd'hui dans l'ensemble Montpellier Plant Phenotyping Platforms (M3P) qui fait partie du réseau Investissement d'Avenir PHENOME. Elles accueillent environ 50% d'expérimentations extérieures à l'unité de recherche dans le cadre de projet internationaux et internationaux, sur une grande variété d'espèces (maïs, blé, vigne, pommier, sorgho, ...).

Plus d'une cinquantaine de publications scientifiques sont issues des travaux menés sur ces plateformes et ce chiffre augmente régulièrement.

Télécharger la Plaquette M3P.

Plateforme PHENODYN 

La plateforme PHENODYN est située dans une serre S1 de 180 m² et permet la mesure en continu la croissance foliaire grâce à autant de capteurs de déplacements rotatifs et la transpiration de 420 plantes de céréales (maïs, riz, blé…) regroupées sur 140 balances, à un pas de temps du ¼ d’heure. La croissance peut ainsi être reliée au niveau de disponibilité en eau dans le sol ainsi qu’aux conditions environnementales (rayonnement, températures d’air et de feuilles, demande évaporative). PHENODYN comprend également deux chambres de cultures de 25 m² chacune permettant de fixer les conditions environnementales et de dresser rapidement des courbes de réponse. 

La présentation détaillée est disponible à l’URL: plateforme PHENODYN

 Plateforme PHENOPSIS 

La plateforme PHENOPSIS est un automate d'irrigation et de prises d'images situé en chambre de culture de 1,5 x 5 m. Il s'agit d'un prototype construit par Optimalog (France) en 2003. Depuis 2007, le LEPSE dispose de 3 automates PHENOPSIS. Grâce à un bras amovible il permet de peser, d'irriguer précisément jusqu'à un poids cible défini par l'expérimentateur et prendre des images (visible, infra-rouge, fluorescence) sur plus de 500 petites plantes comme la plante modèle Arabidopsis thaliana ou Brachypodium dans des conditions environnementales rigoureusement contrôlées.

La présentation détaillée est disponible à l’URL : plateforme PHENOPSIS

Plateau PHENOARCH 

Installée dans une serre de 350 m², la plateforme PhenoArch est basée sur un convoyeur qui transporte 1700 plantes en pots entre des espaces d'irrigation et une chambre d’imagerie. Les images recueillies et le suivi du poids des pots permettent d'estimer  la croissance et la transpiration et d'estimer l'efficience d'utilisation de l'eau. Des pipelines d'analyse permettent d'estimer le rayonnement incident ainsi que le rayonnement intercepté par chaque plante et en déduire l'efficience d'utilisation du rayonnement. PHENOARCH est couvert de capteurs environnementaux permettant d'estimer les conditions perçues par les plantes à chaque instant. Le débit de PHENOARCH lui permet d'être utilisé pour des analyses de génétique d'association ainsi que pour de la sélection génomique. 

La présentation détaillée est disponible à l’URL : plateforme PHENOARCH