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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

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LEPSE

SPIC : Stress Environnementaux et Processus Intégrés

D. Vile, B. Muller, M. Dauzat, G. Rolland, A. Bédiée (ancien membre : C. Granier)

Objectifs et méthodologies

Nous analysons l’effet des contraintes hydriques et thermiques sur le développement et la physiologie de la plante dans le but d’identifier des voies permettant un renforcement de la capacité d’adaptation. Nos approchent expérimentales et de modélisation englobent plusieurs échelles d'organisation biologique. Ainsi, certains travaux se focalisent sur le rôle du cycle cellulaire, de l’endoréduplication, du métabolisme carboné ou des flux d’eau dans la plante, mais nous tendons vers une approche qui intègre l'ensemble des compromis physiologiques. Chez Arabidopsis thaliana, nous utilisons la variabilité naturelle et des lignées génétiquement modifiées disponibles pour tester des hypothèses relatives à ces déterminismes. Tout ceci est réalisé en combinant écophysiologie, génétique quantitative, physiologie, biologie moléculaire et modélisation. 

SPIC-2017-web

Financements

Nos principales sources de financement sont l'INRA, l'établissement SUPAGRO, la région Languedoc Roussillon (projet APSEVIR), Agropolis Fondation (Projets 3D-leaf et tomates), l’ANR (Projets Drought Natural Variation, CKI-Stress, PHENOME), l’Europe (Projets AgronOmics; AgWaterBreed, EPPN, Root Barriers, ModCarbostress) et la société BAYER (bourses de thèse CIFRE).

Publications récentes 

Roucou A, Violle C, Fort F, Roumet P, Ecarnot M and Vile D. Shifts in plant functional strategies over the course of tetraploid wheat domestication. Journal of Applied Ecology (online early). DOI: 10.1111/1365-2664.13029

Lièvre M., Granier C., Guédon Y. (2016) Identifying developmental phases in Arabidopsis thaliana rosette using integrative segmentation models. New Phytologist. 210, 1466-1478.

Bresson J., Vasseur F., Dauzat M., Koch G., Granier C., Vile D. (2015) Quantifying spatial heterogeneity of chlorophyll fluorescence during plant growth and in response to water stress. Plant Methods, 11 (1), 23.

Granier C., Vile D. (2014) Phenotyping and beyond: modelling the relationships between traits. Current Opinion in Plant Biology. 18, 96-102

Vasseur F., Bontpart T., Dauzat M., Granier C. & Vile D. (2014) Multivariate genetic analysis of plant responses to water deficit and high temperature revealed contrasted adaptive strategies. Journal of Experimental Botany. 65 (22) 6457-6469.

Lièvre M., Wuyts N., Cookson S.J., Bresson J., Dapp M., Vasseur F., Massonnet C., Tisne S., Bettembourg M., Balsera C., Bédiée A., Bouvery F., Dauzat M., Rolland G., Vile D. & Granier C. (2013) Phenotyping the kinematics of leaf development in flowering plants: recommendations and pitfalls. WIREs Developmental Biology 2: 809-821.

Pantin F., Fanciullino A.L., Massonnet C., Dauzat M., Simonneau T., Muller B. (2013) Buffering growth variations against water deficits through timely carbon usage. Frontiers in Plant Sciences 4: 483.

Baerenfaller K., Massonnet C., Walsh S., Baginsky S., Bühlmann P., Hennig L., Hirsch-Hoffmann M., Howell K. A., Kahlau S., Radziejwoski A., Russenberger D., Rutishauser D., Small I., Stekhoven D., Sulpice R., Svozil J., Wuyts N., Stitt M., Hilson P., Granier C. & Wilhelm G.  (2012) Systems-based analysis of Arabidopsis leaf growth reveals adaptation to water deficit. Molecular Systems Biology 8: 606.

Principales collaborations

Max Planck Institutes in Koln (M. Koornneef), in Golm (M. Stitt) and Tübingen (D. Weigel)

Gent University (L. de Veylder)

ETH Zurich (K. Baerenfaller, W. Gruissem)

Juelich Plant Phenotyping Center (R. Pieruchka, F. Fiorani)

Warsaw University (W. Rymaszewski)

Massachusetts University (S. Hazen)

Lancaster University (W.J. Davies)

BPMP Montpellier (P. Nacry, C. Maurel, F. Gosti)

CEFE Montpellier (C. Violle)

BGPI Montpellier (M. Van Munster)

Virtual Plant team Montpellier (Y. Guédon)

INRA BFP Bordeaux (C. Chevalier, J.P. Renaudin, C. Cheniclet)

INRA PSH Avignon (N. Bertin, V. Baldazzi)

CNRS IBMP Strasbourg (P. Genschik)

Chercheurs de l'équipe SPIC