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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

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Inra Transfert Environnement

Analyses et études microbiologiques

INRA Transfert Environnement réalise à l'aide des outils moléculaires de nouvelle génération, l'étude approfondie de la microbiologie des écosystèmes complexes et environnementaux

Quels sont vos besoins ?

Connaître les microorganismes présents dans votre échantillon : Bactéries, Archées, Eucaryotes ?

Les communautés microbiennes sont-elles identiques ou différentes, entre mes échantillons ?

  • Selon les traitements ou procédés appliqués ?
  • Dans le temps ?

 Des pathogènes sont-ils présents dans mes échantillons ?

 Comment puis-je connaître ou tracer une pollution microbiologique à l’aide de bioindicateurs ?

Posez-nous vos questions, nous vous apportons notre expertise.

Contactez-nous directement, votre demande sera analysée par notre équipe scientifique afin de répondre au mieux à vos attentes.

Prestations d’analyses et études microbiologiques :

INRA Transfert-Environnement s'appuie, pour la réalisation de ces prestations sur  les outils moléculaires et d’imagerie de la plateforme d’analyse microbiologique du Laboratoire INRA de Biotechnologie de l'Environnement.

Le parc instrumental de la plate-forme associé à un savoir-faire acquis depuis plus de 15 ans permet la réalisation d’une vaste gamme d'analyses.

  • Collecter la microflore d’échantillons très variés : Air, biogaz, eaux, boues, effluents, résidus, bioprocédé (biofiltre, composts, digesteurs,STEP...), biofilms, matériaux de construction et de décoration, …
  • Extraire et amplifier l’ADN et l’ARN de matrices différentes
  • Créer et conserver votre banque d’ADN, d'ARN    

  

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  • Observer les échantillons par microscopie (optique, épifluorescence, biofilm en stéréo-microscopie…
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  • Comparer les échantillons sur la base de la diversité bactérienne, eucaryote et archée par un outil d’empreinte moléculaire (CE-SSCP)
  • Mesurer la diversité microbienne d’un échantillon par des calculs d’indice de diversité (Indice de Simpson)
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  • Mesurer par PCR quantitative en temps réel,  les concentrations en micro-oganismes totaux (Bactéries, Eucaryotes, Archées) mais également de groupes microbiens spécifiques : Legionella, Salmonella, E. coli,  Staphylococcus, Clostridium perfringens...
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  • Identifier par pyroséquençage les microorganismes présents
  • Caractériser par bioinformatique les microorganismes identifiés (données sur l’origine, le potentiel de pathogénicité…)
  • Définir des bio-indicateurs spécifiques des environnements étudiés
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Pour obtenir un devis, contactez notre service commercial. 

Voir aussi

Exemples de réalisations:

  • Mise au point des systèmes de PCR quantitative pour le développement d'un bioindicateur de la qualité de l'air,
  • Identification métagénomique des populations microbiennes d'écosystèmes complexes par séquençage à haut débit,
  • Mesure et suivi de la biodiversité en aval des rejets de stations d'épurations.