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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Centre de Biologie pour la Gestion des Populations - UMR Inra, IRD, Cirad, Montpellier SupAgro

Publications 2018

Articles de revue à comité de lecture (revues de rang A)

Abul-Sood M.I., Gadallah N.S., Hossni M.T. & Delvare G. 2018. The subfamily Cratocentrinae (Hymenoptera: Chalcididae): reappraisal of their morphological characters and review of the West Palaearctic species, with the description of two new species. Zootaxa 4377(4): 490-516 (http://dx.doi.org/10.11646/zootaxa.4377.4.2)

Aghová T., Kimura Y., Bryja J., Dobigny G., Granjon L. & Kergoat G.J. 2018. Fossils know it best: using a new set of fossil calibrations to improve the temporal phylogenetic framework of murid rodents (Rodentia: Muridae). Molecular Phylogenetics and Evolution 128: 98-111 (http://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2018.07.017)

Aït-Hamza M., Moukhli A., Ferji Z., Fossati-Gaschignard O., Tavoillot J., Ali N., Boubaker H., El Mousadik A. & Mateille T. 2018. Diversity of plant-parasitic nematode communities associated with olive nurseries in Morocco: origin and environmental impacts. Applied Soil Ecology 124: 7-16 (http://dx.doi.org/10.1016/j.apsoil.2017.10.019)

Akimenko V.V. & Piou C. 2018. Two-compartment age-structured model of solitarious and gregarious locust population dynamics. Mathematical Methods in the Applied Sciences 41(18): 8636-8672  (http://dx.doi.org/10.1002/mma.4947)

Azandeme Hounmalon G.Y., Maniania N.K., Niassy S., Fellous S., Kreiter S., Deletre E., Fiaboe K.K. & Martin T. 2018. Performance of Metarhizium anisopliae-treated foam in combination with Phytoseiulus longipes Evans on Tetranychus evansi Baker & Pritchard (Acari: Tetranychidae). Pest Management Science 74(12): 2835-2841 (http://dx.doi.org/10.1002/ps.5073)

Bagny Beilhe L., Piou C., Tadu Z. & Babin R. 2018. Identifying ant-mirid spatial interactions to improve biological control in cacao-based agroforestry system. Environmental Entomology 47(3): 551-558 (http://dx.doi.org/10.1093/ee/nvy018)

Ben Chaabana S., Chermiti B. & Kreiter S. 2018. Biology and life-table of Typhlodromus (Anthoseius) athenas (Acari: Phytoseiidae) fed with the Old World Date Mite, Oligonychus afrasiaticus (Acari: Tetranychidae). Acarologia 58(1): 52-61 (http://dx.doi.org/10.24349/acarologia/20184229)

Berry V., Chevenet F., Doyon J.P. & Jousselin E. 2018. A geography-aware reconciliation method to investigate diversification patterns in host/parasite interactions. Molecular Ecology Resources 18(5): 1173-1184 (http://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.12897)

Bertin A., Correa Pavinato V.A. & Parra J.R.P. 2018. Effects of intraspecific hybridization on the fitness of the egg parasitoid Trichogramma galloi. Biocontrol 63(4): 555-563 (http://dx.doi.org/10.1007/s10526-018-9883-7)

Bidu C., Escoula Q., Bellenger S., Spor A., Galan M., Geissler A., Bouchot A., Dardevet D., Morio-Liondor B., Cani P., Lagrost L., Narce M. & Bellenger J. 2018. The transplantation of ω3 PUFA-altered gut microbiota of fat-1 mice to wild-type littermates prevents obesity and associated metabolic disorders. Diabetes 67(8): 1512-1523 (http://dx.doi.org/10.2337/db17-1488)

Bras A., Sauné L., Roques A., Rousselet J. & Auger-Rozenberg M.-A. 2018. Isolation and characterization of 15 microsatellite markers for the highly invasive box tree moth Cydalima perspectalis (Lepidoptera: Crambidae). European Journal of Entomology 115: 264-267 (http://dx.doi.org/10.14411/eje.2018.026)

Brevault T., Ndiaye A., Badiane D., Bal A.B., Sembene M., Silvie P. & Haran J. 2018. First records of the fall armyworm, Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae), in Senegal. Entomologia Generalis 37(2): 129-142 (http://dx.doi.org/10.1127/entomologia/2018/0553)

Brouat C., Diagne C.A., Ismail K., Aroussi A., Dalecky A., Bâ K., Kane M., Niang Y., Diallo M., Sow A., Galal L., Piry S., Darde M.L. & Mercier A. 2018. Seroprevalence of Toxoplasma gondii in commensal rodents sampled across Senegal, West Africa. Parasite 25: 32 (http://dx.doi.org/10.1051/parasite/2018036)

Brousseau L., Nidelet S. & Streiff R. 2018. New WGS data and annotation of the heterosomal vs. autosomal localization of Ostrinia scapulalis (Lepidoptera, Crambidae) nuclear genomic scaffolds. Data in Brief 20: 644-648 (http://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2018.08.011)

Cassan C., Diagne C., Tatard C., Gauthier P., Dalecky A., Bâ K., Kane M., Niang Y., Diallo M., Sow A., Brouat C. & Banuls A.L. 2018. Leishmania major and Trypanosoma lewisi infection in invasive and native rodents in Senegal. PLoS Neglected Tropical Diseases 12(6): e0006615 (http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0006615)

Catalano S., Sene M., Diouf N.D., Fall C.B., Borlase A., Leger E., Bâ K. & Webster J.P. 2018. Rodents as natural hosts of zoonotic Schistosoma species and hybrids: an epidemiological and evolutionary perspective from West Africa. Journal of Infectious Diseases 218(3): 429-433 (http://dx.doi.org/10.1093/infdis/jiy029)

Clemente F., Gautier M. & Vitalis R. 2018. Inferring sex-specific demographic history from SNP data. PLoS Genetics 14(1): e1007191 (http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1007191)

Coleman R.A., Gauffre B., Pavlova A., Beheregaray L.B., Kearns J., Lyon J., Sasaki M., Leblois R., Sgro C. & Sunnucks P. 2018. Artificial barriers prevent genetic recovery of small isolated populations of a low-mobility freshwater fish. Heredity 120(6): 515-532 (http://dx.doi.org/10.1038/s41437-017-0008-3)

Collet J.M., Mc Guigan K., Allen S.L., Chenoweth S.F. & Blows M.W. 2018. Mutational pleiotropy and the strength of stabilizing selection within and between functional modules of gene expression. Genetics 208(4): 1601-1616 (http://dx.doi.org/10.1534/genetics.118.300776)

Condamine F.L., Nabholz B., Clamens A.-L., Dupuis J.R. & Sperling F.A.H. 2018. Mitochondrial phylogenomics, the origin of swallowtail butterflies, and the impact of the number of clocks in Bayesian molecular dating. Systematic Entomology 43(3): 460-480 (http://dx.doi.org/10.1111/syen.12284)

Cruaud A., Groussier G., Genson G., Sauné L., Polaszek A. & Rasplus J.-Y. 2018. Pushing the limits of whole genome amplification: successful sequencing of RADseq library from a single microhymenopteran (Chalcidoidea, Trichogramma). PeerJ 6: e5640 (http://dx.doi.org/10.7717/peerj.5640)

Cruaud A., Gonzalez A.-A., Godefroid M., Nidelet S., Streito J.-C., Thuillier J.-M., Rossi J.-P., Santoni S. & Rasplus J.-Y. 2018. Using insects to detect, monitor and predict the distribution of Xylella fastidiosa: a case study in Corsica. Scientific Reports 8(1): 15628 (http://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-33957-z)

Dahmani M., Diatta G., Labas N., Diop A., Bassene H., Raoult D., Granjon L., Fenollar F. & Mediannikov O. 2018. Non-contiguous finished genome sequence and description of Bartonella mastomydis sp. nov. New Microbes and New Infections 25: 60-70 (http://dx.doi.org/10.1016/j.nmni.2018.03.005)

Débarre F., Rode N.O. & Ugelvig L.V. 2018. Gender equity at scientific events. Evolution Letters 2(3): 148-158 (http://dx.doi.org/10.1002/evl3.49)

Delvare G. & Copeland R.S. 2018. Four-horned wasps, description of some remarkable Dirhinus (Hymenoptera, Chalcididae) from Kenya, with a discussion of their taxonomic placement. Zootaxa 4374(3): 301-349 (http://dx.doi.org/10.11646/zootaxa.4374.3.1)

Dobigny G., Gauthier P., Houéménou G., Choplin A., Dossou H.J., Badou S., Etougbétché J., Bourhy P., Koffi S., Durski K.N., Bertherat E. & Picardeau M. 2018. Leptospirosis and extensive urbanization in West Africa: a neglected and underestimated threat? Urban Science 2(2): 29 (http://dx.doi.org/10.3390/urbansci2020029)

Dong J., Kergoat G.J., Vicente N., Rahmadi C., Xu S. & Robillard T. 2018. Biogeographic patterns and diversification dynamics of the genus Cardiodactylus Saussure (Orthoptera, Grylloidea, Eneopterinae) in Southeast Asia. Molecular Phylogenetics and Evolution 129: 1-14 (http://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2018.06.001)

D'Ortenzio E., Lemaitre N., Brouat C., Loubet P., Sebbane F., Rajerison M., Baril L. & Yazdanpanah Y. 2018. Plague: Bridging gaps towards better disease control. Médecine et Maladies Infectieuses 48(5): 307-317 (http://dx.doi.org/10.1016/j.medmal.2018.04.393)

Dubois A., Castel G., Murri S., Pulido C., Pons J.B., Benoit L., Loiseau A., Lakhdar L., Galan M., Marianneau P. & Charbonnel N. 2018. Bank vole immunoheterogeneity may limit nephropatia epidemica emergence in a French non-endemic region. Parasitology 145(3): 393-407 (http://dx.doi.org/10.1017/S0031182017001548)

Elias L.G., Kjellberg F., Farache F., Almeida E.A.B., Rasplus J.-Y., Cruaud A., Peng Y.-Q., Yang D.-R. & Pereira R.A.S. 2018. Ovipositor morphology correlates with life history evolution in agaonid fig wasps. Acta Oecologica 90: 109-116 (http://dx.doi.org/10.1016/j.actao.2017.10.007)

Escorihuela M.J., Merlin O., Stefan V., Moyano G., Eweys O.A., Zribi M., Kamara S., Benahi A.S., Ebbe M.A.B., Chihrane J., Ghaout S., Cissé S., Diakité F., Lazar M., Pellarin T., Grippa M., Cressman K. & Piou C. 2018. SMOS based high resolution soil moisture estimates for desert locust preventive management. Remote Sensing Applications: Society and Environment 11: 140-150 (http://dx.doi.org/10.1016/j.rsase.2018.06.002)

Estoup A., Raynal L., Verdu P. & Marin J.-M. 2018. Model choice using Approximate Bayesian Computation and Random Forests: analyses based on model grouping to make inferences about the genetic history of Pygmy human populations. Journal de la Société Française de Statistiques 159(3): 167-190

Fabre P.H., Fitriana Y.S., Semiadi G., Pagès M., Aplin K., Supriatna N. & Helgen K.M. 2018. New record of Melomys burtoni (Mammalia, Rodentia, Murinae) from Halmahera (North Moluccas, Indonesia): a review of Moluccan Melomys. Mammalia 82(3): 218-247 (http://dx.doi.org/10.1515/mammalia-2016-0137)

Fagua G.G., Condamine F.L., Brunet B.M.T., Clamens A.-L., Laroche J., Levesque R.C., Cusson M. & Sperling F.A.H. 2018. Convergent herbivory on conifers by Choristoneura moths after boreal forest formation. Molecular Phylogenetics and Evolution 123: 35-43 (http://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2018.01.013)

Falahatpisheh A., Fallahzadeh M., Dousti A. & Delvare G. 2018. Review of Iranian Chalcididae (Hymenoptera, Chalcidoidea) with nomenclatural notes. Zootaxa 4394(2): 251-269 (http://dx.doi.org/10.11646/zootaxa.4394.2.8)

Farache F., Cruaud A., Rasplus J.-Y., Cerezini M.T., Rattis L., Kjellberg F. & Pereira R.A.S. 2018. Insights into the structure of plant-insect communities: Specialism and generalism in a regional set of non-pollinating fig wasp communities. Acta Oecologica 90: 49-59 (http://dx.doi.org/10.1016/j.actao.2018.02.006)

Farache F.H.A., Pereira C.B., Koschnitzke C., Barros L.O., Souza E.M.d.C., Felício D.T., Gatti F., Cardona W., Rasplus J.-Y. & Pereira R.A.S. 2018. The unknown followers: Discovery of a new species of Sycobia Walker (Hymenoptera: Epichrysomallinae) associated with Ficus benjamina L. (Moraceae) in the Neotropical region. Journal of Hymenoptera Research 67: 85-102 (http://dx.doi.org/10.3897/jhr.67.29733)

Fermon Y., Fossati-Gaschignard O. & Meunier F.J. 2018. Fish fauna survey on the Upper Maroni (French Guyana) between 2000 and 2002 with some ecological considerations. Cybium 42(1): 113-126

Forin-Wiart M.-A., Poulle M.-L., Piry S., Cosson J.-F., Larose C. & Galan M. 2018. Evaluating metabarcoding to analyse diet composition of species foraging in anthropogenic landscapes using Ion Torrent and Illumina sequencing. Scientific Reports 8(1): 17091 (http://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-34430-7)

Galan M., Pons J.B., Tournayre O., Pierre E., Leuchtmann M., Pontier D. & Charbonnel N. 2018. Metabarcoding for the parallel identification of several hundred predators and their prey: application to bat species diet analysis. Molecular Ecology Resources 18(3): 474-489 (http://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.12749)

Gautier M., Yamaguchi J., Foucaud J., Loiseau A., Ausset A., Facon B., Gschloessl B., Lagnel J., Loire E., Parrinello H., Severac D., Lopez-Roques C., Donnadieu C., Manno M., Berges H., Gharbi K., Lawson-Handley L., Zang L.S., Vogel H., Estoup A. & Prud'homme B. 2018. The genomic basis of color pattern polymorphism in the Harlequin ladybird. Current Biology 28(20): 3296-3302 (http://dx.doi.org/10.1016/j.cub.2018.08.023)

Gay P.-E., Lecoq M. & Piou C. 2018. Improving preventive locust management: insights from a multi-agent model. Pest Management Science 74(1): 46-58 (http://dx.doi.org/10.1002/ps.4648)

Gibon F.M. 2018. Ecnomus of Madagascar, species without modified spur (Trichoptera: Ecnomidae). Annales de la Société entomologique de France (NS) 54(1): 51-66 (http://dx.doi.org/10.1080/00379271.2017.1411210)

Gibon F.-M. 2018. The Chimarra of the georgensis and fallax species groups in Madagascar (Trichoptera, Philopotamidae) Oriental Insects 52(2): 113-127 (http://dx.doi.org/10.1080/00305316.2017.1379448)

Goeury T., Creary L., Brunet L., Galan M., Pasquier M., Kervaire B., Langaney A., Tiercy J.M., Fernandez-Viña M., Nunes J.M. & Sanchez-Mazas A. 2018. Deciphering the fine nucleotide diversity of full HLA class I and class II genes in a well-documented population from sub-Saharan Africa. HLA: Immune Response Genetics 91(1): 36-51 (http://dx.doi.org/10.1111/tan.13180)

Grange T., Brugal J.-P., Flori L., Gautier M., Uzunidis A. & Geigl E.-M. 2018. The evolution and population diversity of bison in Pleistocene and Holocene Eurasia: sex matters. Diversity 10(3): 65 (http://dx.doi.org/10.3390/d10030065)

Gschloessl B., Dorkeld F., Audiot P., Bretaudeau A., Kerdelhué C. & Streiff R. 2018. De novo genome and transcriptome resources of the Adzuki bean borer Ostrinia scapulalis (Lepidoptera: Crambidae). Data in Brief 17: 781-787 (http://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2018.01.073)

Gschloessl B., Dorkeld F., Berges H., Beydon G., Bouchez O., Branco M., Bretaudeau A., Burban C., Dubois E., Gauthier P., Lhuillier E., Nichols J., Nidelet S., Rocha S., Sauné L., Streiff R., Gautier M. & Kerdelhué C. 2018. Draft genome and reference transcriptomic resources for the urticating pine defoliator Thaumetopoea pityocampa (Lepidoptera: Notodontidae). Molecular Ecology Resources 18(3): 602-619 (http://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.12756)

Guivier E., Martin J.-F., Pech N., Ungaro A., Chappaz R. & Gilles A. 2018. Microbiota diversity within and between the tissues of two wild interbreeding species. Microbial Ecology 75(3): 799-810 (http://dx.doi.org/10.1007/s00248-017-1077-9)

Guivier E., Criscuolo F., Zahn S., Bellenger J., Galan M., Faivre B. & Sorci G. 2018. Early life infection and host senescence. Experimental Gerontology 114: 19-26 (http://dx.doi.org/10.1016/j.exger.2018.10.013)

Guyomar C., Legeai F., Jousselin E., Mougel C., Lemaitre C. & Simon J.C. 2018. Multi-scale characterization of symbiont diversity in the pea aphid complex through metagenomic approaches. Microbiome 6(1): 181 (http://dx.doi.org/10.1186/s40168-018-0562-9)

Hamadeh B., Chalak L., d'Eeckenbrugge G.C., Benoit L. & Joly H.I. 2018. Evolution of almond genetic diversity and farmer practices in Lebanon: impacts of the diffusion of a graft-propagated cultivar in a traditional system based on seed-propagation. BMC Plant Biology 18: 155 (http://dx.doi.org/10.1186/s12870-018-1372-8)

Haran J. 2018. A review of the genus Smicronyx Schoenherr (Coleoptera, Curculionidae, Curculioninae) in tropical Africa. Zootaxa 4508(2): 267-287 (http://dx.doi.org/10.11646/zootaxa.4508.2.9)

Haran J., Rousselet J., Tellez D., Roques A. & Roux G. 2018. Phylogeography of Monochamus galloprovincialis, the European vector of the pinewood nematode. Journal of Pest Science 91 (1): 247-257 (http://dx.doi.org/10.1007/s10340-017-0878-4)

Haran J., Delvare G., Vayssières J.-F., Benoit L., Cruaud P., Rasplus J.-Y. & Cruaud A. 2018. Increasing the utility of barcode databases through high-throughput sequencing of amplicons from dried museum specimens, an example on parasitic hymenoptera (Braconidae). Biological Control 122: 93-100 (http://dx.doi.org/10.1016/j.biocontrol.2018.04.001)

Hivert V., Leblois R., Petit E.J., Gautier M. & Vitalis R. 2018. Measuring genetic differentiation from Pool-seq data. Genetics 210: 315-330 (http://dx.doi.org/10.1534/genetics.118.300900)

Iltis C., Martel G., Thiery D., Moreau J. & Louapre P. 2018. When warmer means weaker: high temperatures reduce behavioural and immune defences of the larvae of a major grapevine pest. Journal of Pest Science 91(4): 1315-1326 (http://dx.doi.org/10.1007/s10340-018-0992-y)

Janšta P., Cruaud A., Delvare G., Heraty J. & Rasplus J.-Y. 2018. Torymidae (Hymenoptera, Chalcidoidea) revised: molecular phylogeny, circumscription and reclassification of the family with discussion of its biogeography and evolution of life-history traits. Cladistics 34(6): 627-651 (http://dx.doi.org/10.1111/cla.12228)

Kergoat G.J., Condamine F.L., Toussaint F.A., Capdevielle-Dulac C., Clamens A.-L., Barbut J., Goldstein P.Z. & Le Ru B. 2018. Opposite macroevolutionary responses to environmental changes in grasses and insects during the Neogene grassland expansion. Nature Communications 9: 5089 (http://dx.doi.org/10.1038/s41467-018-07537-8)

Kontschán J., Lorne M. & Kreiter S. 2018. First record of Penthalodes ovalis (Dugès, 1834) in agricultural area with notes on its pest status (Acari: Penthalodidae). Acta Phytopathologica et Entomologica Hungarica 53(2): 253-257 (http://dx.doi.org/10.1556/038.53.2018.017)

Kreisinger J., Schmiedova L., Petrzelkova A., Tomasek O., Adamkova M., Michalkova R., Martin J.-F. & Albrecht T. 2018. Fecal microbiota associated with phytohaemagglutinin-induced immune response in nestlings of a passerine bird. Ecology and Evolution 8(19): 9793-9802 (http://dx.doi.org/10.1002/ece3.4454)

Kreiter S., Payet R.-M., Fillâtre J. & Abdou Azali H. 2018. First records of Phytoseiidae (Acari: Mesostigmata) from one island of the Comoros Archipelago. Acarologia: 58(3): 529-545 (http://dx.doi.org/10.24349/acarologia/20184256)

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Granjon L. 2018. Rongeurs invasifs au Sénégal: scénarios d'expansion et retour d'information vers les populations. Atelier du GDRI-Sud "West African Network on Biological Invasions". 5-6 Décembre 2018.  Cotonou, Bénin.

Haran J., Benoit L., & Addison P. 2018. Taxonomy 2.0: a tool to detect, identify and manage invasive insect pests. 45th Annual Research Symposium on the Management of Biological Invasions in Southern Africa. 3-6 Juillet 2018.  Thohoyandou, South Africa.

Haran J., van Noort S., Benoit L., & Addison P. 2018. The identification of hymenopteran parasitoids of fruit flies and their specific host relationships using a next generation taxonomy approach. 9th International Congress of Dipterology. 25-30 Novembre 2018.  Windhoek, Namibia.

Hivert V. 2018. Measuring genetic differentiation from Pool-seq data. DrosEU/ESEB STN Summer School on Adaptation Genomics. 23-24 Août 2018.  Montpellier, France.

Javal M., Lombaert E., Courtin C., Kerdelhué C., Tsykun T., Prospero S., Roques A., & Roux G. 2018. Traçage des routes d’invasion d’un insecte ravageur polyphage : le cas du capricorne asiatique Anoplophora glabripennis. International Conference on Ecological Sciences, workshop "biological invasions". 22-25 Octobre 2018.  Rennes, France.

Kerdelhué C., Battisti A., Branco M., Simonato M., Rousselet J., & Roques A. 2018. Using population genetics and genomic approaches to decipher the recent history of forest pest insects and improve management strategies. European Congress of Entomology. 2-6 Juillet 2018. Naples, Italie.

Kerdelhué C., Burban C., Rocha S., Godefroid M., Rossi J.-P., Gautier M., Leblois R., Santos H., & Branco M. 2018. Allochronic differentiation in the pine processionary moth: possible impacts of past and future climate changes. International Processionary Meeting. 6-7 Décembre 2018. Hammamet, Tunisie.

Kerdelhué C., Simonato M., Sauné L., Roques A., Rousselet J., & Battisti A. 2018. Understanding the origin of invasive populations of the pine processionary moth: a population genetic approach. International Processionary Meeting. 6-7 Décembre 2018. Hammamet, Tunisie.

Kreiter S., Payet R.-M., Fontaine O., Fillâtre J., Azali H. A., & Le Bellec F. 2018. Phytoseiidae (Acari: Mesostigmata) of the Indian Ocean. Biodiversity and new potential for development of biological control in this area. XV International Congress of Acarology (ICA 2018). 2-8 Septembre 2018. Antalya, Turkey.

Lagnel J., Estoup A., Donnadieu C., Lopez-Roques C., Manno M., Loiseau A., & Gautier M. 2018a. Apport de la technologie Oxford NanoPore pour l’assemblage de novo du génome d’espèces non-modèles : le cas de la coccinelle asiatique Harmonia axyridis. Montpellier OMICS Days- Conférence annuelle de bioinformatique & statistiques. 8-9 Février 2018.  Montpellier, France.

Lagnel J., Estoup A., Donnadieu C., Lopez-Roques C., Manno M., Loiseau A., & Gautier M. 2018b. Apport de la technologie Oxford NanoPore pour l’assemblage de novo du génome d’espèces non-modèles : le cas de la coccinelle asiatique Harmonia axyridis. Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM). 3-6 Juillet 2018.  Marseille, France.

Lagnel J., Estoup A., Donnadieu C., Lopez-Roques C., Manno M., Loiseau A., & Gautier M. 2018c. Contribution of Oxford NanoPore technology for the de novo genome assembly of nonmodel species: the case of the Asian ladybird Harmonia axyridis. Réunion France Génomique. 29-30 novembre 2018.  Evry, France.

Lesieur V., Thomann T., Jourdan M., Ollivier M., Sheppard A., Martin J.-F.,Tixier M.-S., Morin L., & Raghu S. 2018. Biological control of Sonchus oleraceus: what is known, what is new and what is still missing? 21th Australasian Weeds Conference. 9-12 Septembre 2018.  Sydney, Australie.

Manzano Marin A. 2018. Buchnera's sidekicks: The who and how of co-obligate nutritional symbioses across aphids. Final Meeting of the PRC Israel-France. 20 Novembre 2018.  Lyon, France.

Manzano Marin A., Coeur d'acier A., Clamens A.-L., Orvain C., Cruaud C., Barbe V., & Jousselin E. 2018. Ongoing Symbiont Replacement in the Aphid Cinara strobi. Recontres ALPHY/GTGC. 7-8 Février 2018. Montpellier, France.

Marčić D., Marić I., Medo I., Jovanovic S., Petanović R., & Auger P. 2018. Spider mites on medicinal and endemic plants of Serbia and the Balkans. XV International Congress of Acarology (ICA 2018). 2-8 Septembre 2018.  Antalaya, Turkey.

Marić I., Medo I., Jovanovic S., Petanović R., Marčić D., & Auger P. 2018. Biodiversity of spider mites in the Tara National Park in Serbia. XV International Congress of Acarology (ICA 2018). 2-8 Septembre 2018.  Antalaya, Turkey.

Mérel V., Fablet M., Boulesteix M., Estoup A., Gibert P., & Vieira C. 2018. Transposable Element Dynamics in an Invasive Species. Congrès National des Éléments Transposables. 2-4 Juillet 2018.  Clermont-Ferrand, France.

Meynard C. N. 2018. Bringing macroecology into agricultural science: promises and challenges. International Conference on Ecological Sciences, Réunion de la Société Française d'Ecologie et Evolution. 22-25 Octobre 2018.  Rennes, France.

Michel B., & François A. 2018. Contribution to the Knowledge of the Neuroptera of the Oriental Region of Morocco. XIIIe International Symposium on Neuropterology. 18-21 Juin 2018. Laufen, Allemagne.

Miralles A., Geniez P., Brito J. C., Sorouille P., Mendez-Aaranda D., Beddek M., Leblois R., & Crochet P.-A. 2018. Taxonomie des Acanthodactyles à queue rouge (Acanthodactylus erythrurus, Squamata) : une approche intégrative révèle la diversité cryptique dans l’Atlas marocain. Co-meeting: VIème Congrès Franco-Tunisien de Zoologie, VI ème Congrès Franco-Maghrébin de Zoologie et 119èmes Journées Annuelles de la Societé Zoologique de France. 21-23 Novembre 2018.  Paris, France.

Ollivier M., Lesieur V., Jourdan M., Thomann T., Raghu S., Morin L., Sheppard A., Tixier M.-S., & Martin J.-F. 2018. Molecular analysis of ecological interactions for optimizing biocontrol prospection of the invasive weed Sonchus oleraceus L. (Asteraceae). 21th Australasian Weeds Conference. 9-12 Septembre 2018. Sydney, Australie.

Ollivier M., Lesieur V., Jourdan M., Thomann T., Raghu S., Morin L., Sheppard A., Tixier M.-S., & Martin J.-F. 2018. Molecular analysis of ecological interactions for optimizing biocontrol prospection of the invasive weed Sonchus oleraceus L. (Asteraceae). 15th International Symposium on Biological Control of Weed. 26-31 Août 2018.  Engelberg, Suisse.

Pavinato V., Marin J. M., & Navascués M. 2018. Tracking selection in time-series population genomic data using ABC random forests. II Joint Congress on Evolutionary Biology. 19-22 Août 2018.  Montpellier, France.

Pavinato V., Marin J. M., & Navascués M. 2018. Tracking selection in time-series population genomic data using ABC random forests. Mathematical and Computational Evolutionary Biology. 25-29 Juin 2018.  Saint-Martin-de-Londres, France.

Pavinato V., Marin J. M., & Navascués M. 2018. Tracking selection in time-series population genomic data using ABC random forests. Journée scientifique Inter LabEx. 13 Février 2018.  Montpellier, France.

Piou C. 2018. Locust research for preventive management: Cirad’s perspective. Launching the Global Locust Initiative (GLI). 12-14 Avril 2018.  Arizona State University, Tempe, USA.

Rode N., Estoup A., Bourguet D., Courtier-Orgogozo V., & Débarre F. 2018. Can evolutionary biology help better predict the risks associated with population control using gene drives?. Second Joint Congress on Evolutionary Biology. 19-22 août 2018. Montpellier, France.

Rossi J.-P. 2018. Identifier, comprendre, prévoir autour de la situation de crise sanitaire engendrée par Xylella fastidiosa. Les rencontres Inra : observer et prévenir : le numérique pour mieux caractériser les états du milieu. 24 Février-4 Mars 2018.  Salon International de l’Agriculture, Paris, France.

Rossi J.-P. 2018. Plant Health and Environment Division in Inra. Séminaire Inra - Leibniz Association. 24-25 Janvier 2018.  Paris, France.

Smith A. D., Kanda K., Kaminski M., Bouchard P., Flores G., Kergoat G. J., Condamine F. L., Aalbu R., Lamb A., & Purchart L. 2018. Phylogeny and patterns of diversification in darkling beetles (Coleoptera, Tenebrionidae). 5th international Tenebrionoidea symposium. 5-7 Mars 2018. Prague, République Tchèque.

Streito J.-C., Haran J., Benoit L., Goude M., & Perrin B. 2018. Explorer les relations trophiques des punaises du genre Macrolophus : optimiser la régulation naturelle des ravageurs en cultures maraîchères sous abri. 9e Congrès International Francophone d’Entomologie. 2-6 Juillet 2018. Montpellier, France.

Streito J.-C., Genson G., Pierre É., Cruaud A., & Rasplus J.-Y. 2018. Ten years of Heteroptera barcoding at CBGP: outputs and prospects. VIe IHS meeting. 3-7 Décembre 2018.  La Plata, Argentina.

Tixier M.-S., & Kreiter S. 2018. Rules for importations of natural enemies un Europe and secure indentification: the case of Phytoseiidae. XV International Congress of Acarology (ICA 2018). 2-8 Septembre 2018. Antalya, Turkey.

Tixier M.-S., & Dos Santos V. 2018. First molecular phylogenetic and implications for the taxonomy of the family Phytoseiidae (Acari : Mesostigmata). XV International Congress of Acarology. 2-8 Septembre 2018.  Antalya, Turkey.

Tournayre O., Pons J.-B., Leuchtmann M., Duhayer J., Galan M., Loiseau A., Leblois R., Pierre E., Pontier D., & Charbonnel N. 2018. Conservation et écologie du Grand rhinolophe: Que nous apprennent les analyses moléculaires? 17e Rencontre Nationale des Chauves-Souris. 16 mars 2018. Bourges, France.

Tournayre O., Galan M., Pons J. B., Leuchtmann M., Streito J.-C., Pontier D., & Charbonnel N. 2018. The greater horseshoe bat (Rhinolophus ferrumequinum) diet : Optimisation of arthropods DNA identification in guano samples. SFEcologie. 22-25 Octobre 2018.  Rennes, France.

Tournayre O., Galan M., Pons J. B., Pierre E., Leuchtmann M., Pontier D., & Charbonnel N. 2018. Chauves-souris et services écosystémiques :  que nous apprend l'ADN contenu dans le guano? Congrès Ecolotech. 8 Novembre 2018.  Montpellier, France.

Truc P., Tatard C., Houéménou G., Badou S., Dossou H. J., Etougbétché J., Coeur d'acier A., Gauthier P., & Dobigny G. 2018. Very high prevalence of rodent-borne Trypanosoma lewisi in Cotonou, Benin: a new threat for human health? XIVth conference of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases, . 6-9 Novembre, 2018.  Barcelona, Spain.

Virgoulay T., & Leblois R. 2018. Développement et optimisation d’un outils de simulation en c++ de données génomique en populations spécialisés. Printemps de Baillarguet. 28-29 Mai 2018.  Montferrier sur Lez, France.

Vitalis R., Clemente F., & Gautier M. 2018. Inferring sex-specific demographic history from SNP data. Second Joint Congress on Evolutionary Biology. 19-22 Août 2018.  Montpellier, France.

Zaemdzhikova G., Robinet C., Georgieva M., Georgiev G., Bocheva L., Tsankov G., Bernard A., Buradino M., Rossi J.-P., Roques A., Kerdelhué C., Rousselet J., Mirchev P., & Laparie M. 2018. Emergence of atypical phenologies at both longitudinal ends of the northern expansion front of the pine processionary moth: the importance of identifying local drivers. International Processionary Meeting. 6-7 Décembre 2018. Hammamet, Tunisie.

 

Conférences invitées

Dobigny G., Bal A. B., Bertherat E., Bagan T., Ben Temessek M., Hamada N., & Courchamp F. 2018. Invasive species: a focus on Africa. Side-event de la 14ème Conférence des Parties (COP14) de la Convention des Nations-Unies sur la Diversité Biologique (CBD). 17-29 Novembre 2018.  Sharm El Sheikh, Egypte.

Dobigny G., Duplantier J.-M., & Bertherat E. 2018. Rongeurs et santé publique en zone urbaine : des défis propres aux villes africaines ? Actualités du Pharo "Santé dans les villes du Sud", Journées Annuelles du Groupe d'Intervention en Santé Publique et en Epidémiologie. 3-5 Octobre 2018.  Marseilles, France.

Jousselin E. 2018. Evolution de l'endosymbiose obligatoire chez les pucerons : un symbionte peut en cacher un autre. Séminaire d’Ecologie et d’Evolution, UQAM. 10 Octobre 2018.  Montréal, Canada.

Jousselin E. 2018. Evolution des endosymbioses obligatoires chez les pucerons : approches phylogénomiques. Journées scientifiques du Labex Cemeb. 3 Mars 2018.  Montpellier, France.

Jousselin E. 2018. Phylogenetic approaches to study host-plant driven speciation in phytophagous insects : insights from fig wasps and aphids. 34th annual meeting of the ISCE. 12-17  Août 2018.  Budapest, Hungary.

Tixier M.-S. 2018. Molecular phylogeny of predatory mites of the family phytoseiidae. III congresso latino-americano de Acarologia, VI Brazilian symposium of Acarology. 29 Juillet-2 Août 2018.  Pirénepolis, Brazil.

Tixier M.-S. 2018. New concepts and methods for integrated modern systematics. III congresso latino-americano de Acarologia, VI Brazilian symposium of Acarology. 29 Juillet-2 Août 2018.  Pirénepolis, Brazil.

Vitalis R. 2018. How to characterize local adaptation from genome-wide polymorphisms? Journée thématique "Inférences évolutives à partir des données génomiques" co-organisée par les GDR "Génomique Environnementale" et "Approche Interdisciplinaire de l'Evolution Moléculaire". 16 May 2018. Paris, France.

Vitalis R. 2018. How to characterize local adaptation from genome-wide polymorphisms? DrosEU/ESEB STN Summer School on Adaptation Genomics. 23-24 Août 2018.  Montpellier, France.

 

Communiqués de presse

Estoup A., Gautier M., & Prud’homme B. 2018a. Comment la coccinelle arlequin dessine-t-elle ses points rouges ou ses points noirs ? Communiqués de presse INRA. Date: 3 Septembre 2018. (http://presse.inra.fr/Communiques-de-presse/coccinelle-arlequin)

Estoup A., Gautier M., & Prud’homme B. 2018b. La recette génétique des pois rouges ou noirs de la coccinelle. Communiqués de presse CNRS. Date: 3 Septembre 2018. (http://www2.cnrs.fr/presse/communique/5683.htm )

Kergoat G. J. 2018. Les changements environnementaux passés impactent des communautés d’insectes phytophages. Communiqués de presse INRA. Date: 7 Décembre 2018. (http://www.spe.inra.fr/Toutes-les-actualites/Changements-environnementaux-et-insectes-phytophages)

 

Ouvrages et chapitres d'ouvrage

Estoup A., Verdu P., Robert C. P., Marin J.-M., Dehne-Garcia A., Cornuet J.-M., & Pudlo P. 2018. Application of approximate Bayesian computation to infer the genetic history of Pygmy hunter-gatherers populations from Western Central Africa. In: Sisson S., Fan Y. & Beaumont M. (Eds.), Handbook of Approximate Bayesian Computation. New York: Chapman and Hall/CRC pp 541-567.

Marin J. M., Pudlo P., Estoup A., & Robert C. P. 2018. Likelihood-free model choice. In: Sisson S., Fan Y. & Beaumont M. (Eds.), Handbook of Approximate Bayesian Computation. New York: Chapman and Hall/CRC pp 153-178.

 

Posters

Bout A., Ruiz I., Gaumetou C., Sandoval F., Streito J.-C., & Ris N. 2018. Macrolophus melanotoma (Heteroptera Miridae): New aspects to understand this little-known species. VIe IHS meeting. 3-7 Décembre 2018. La Plata, Argentina.

Cazaux B., Castel G., & Rivals E. 2018. AquaPony: Visualization and interpretation of phylogeographic information on phylogenetic trees. JOBIM (Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques). 3-6 juillet 2018. Marseilles, France.

Debelle A., Fellous S., Courtiol A., & Morrow T. 2018. Exploring the environmental dependence of sexual conflict using Drosophila. Evolution 2018. 19-22 Août 2018. Montpellier, France.

Dorkeld F., Gschloessl B., Kerdelhué C., Streiff R., Duvic B., & Ogliastro M. 2018. Exploration of viral communities associated with lepidoptera : A study of Thaumetopoea pityocampa (Notodontidae) and the European corn borer species complex Ostrinia nubilalis / O. scapulalis. 10th International Workshop on the Molecular Biology and Genetics of the Lepidoptera. 19-25 Août 2018. Crête, Grèce.

Fermon Y., & Fossati-Gaschignard O. 2018. The RAMSAR zone of Lower Ogowe: Ecological results of nine months sampling in 2014. Sixth PAFFA (Pan African Fish and Fisheries Association) International Conference: African fish and fisheries: diversity, conservation, sustainable management and development. 24-28 Septembre 2018. Mangochi, Malawi.

Granjon L., Thiam M., Bâ K., Ndiaye A., & Diagne C. 2018. Les rongeurs et leurs parasites indicateurs écologiques des changements environnementaux au nord du Sénégal. Séminaire annuel du Labex DRIIHM. 8-10 Octobre 2018. Marseille, France.

Gschloessl B., Dorkeld F., Audiot P., Bretaudeau A., Burban C., Sauné L., Gautier M., Kerdelhué C., & Streiff R. 2018. Genomic and transcriptomic resources of two Lepidoptera: the Notodontidae Thaumetopoea pityocampa and the Crambidae Ostrinia scapulalis. 10th International Workshop on the Molecular Biology and Genetics of the Lepidoptera. 19-25 Août 2018. Crête, Grèce.

Guilhot R., Becher P., & Fellous S. 2018. Deciphering symbiont effects on host plasticity and ressource acquisition in Drosophila species. Second Joint Congress on Evolutionary Biology. 19-22 août 2018. Montpellier, France.

Hivert V., Leblois R., Petit E. J., Gautier M., & Vitalis R. 2018. Measuring genetic differentiation from pooled population samples. Second Joint Congress on Evolutionary Biology. 19-22 août 2018. Montpellier, France.

Jullien M., Navascués M., Ronfort J., & Gay L. 2018. Diversity and genetic structure in selfing populations in the absence of selection. Sex uncovered: the evolutionary biology of reproductive systems. 23-27 April 2018. Roscoff, France.

Jullien M., Ronfort J., Navascués M., & Gay L. 2018. Genetic structure and temporal dynamics of selfing populations under neutral processes. II Joint Congress on Evolutionary Biology. 19-22 Août 2018. Montpellier, France.

Le Bellec F., Ratnadass A., Rothé M., R.-M. P., Bockstaller C., J.-P. S., & Kreiter S. 2018a. Concevoir des systèmes de cuture agrumicles agro-écologiques. Journée UMT FloriMed. 20-21 novembre 2018. Saint-Pierre, France.

Le Bellec F., Ratnadass A., Rothé M., R.-M. P., Bockstaller C., J.-P. S., & Kreiter S. 2018b. Des enherbements en vergers d’agrumes pour soutenir la lutte biologique. Journée UMT FloriMed. 20-21 novembre 2018. Saint-Pierre, France.

Le Bellec F., Ratnadass A., Rothé M., R.-M. P., Bockstaller C., J.-P. S., & Kreiter S. 2018c. La gestion des adventices en verger : une question de compromis. Journée UMT FloriMed. 20-21 novembre 2018. Saint-Pierre, France.

Lesieur V., Thomann T., Jourdan M., Ollivier M., Sheppard A., Martin J.-F., Tixier M.-S., Morin L., & Raghu S. 2018. A beautiful flower with a bitter taste, Allium triquetrum L., angled onion: a new biological control program. 15th International Symposium on Biological Control of Weed. 26-31 Août 2018. Engelberg, Suisse.

Lesieur V., Thomann T., Jourdan M., Ollivier M., Sheppard A., Martin J.-F., Tixier M.-S., Morin L., & Raghu S. 2018. Biological control of Sonchus oleraceus: what is known, what is new and what is still missing? 15th International Symposium on Biological Control of Weed. 26-31 Août 2018. Engelberg, Suisse.

Madrières S., Murri S., Vulin J., Charbonnel N., Castel G., & Marianneau P. 2018. Analyses expérimentales de la dynamique d’infection du virus Puumala chez Myodes glareolus. XXes Journées Francophones de Virologie. 22-23 mars 2018. Paris, France.

Manzano Marin A., Coeur d'acier A., Clamens A.-L., Orvain C., Cruaud  C., Barbe V., & Jousselin E. 2018. Coming and ceasing to be: Evolution of recent mutualistic associations in aphid endosymbionts. Second Joint Congress on Evolutionary Biology. 19-22 Août 2018. Montpellier, France.

Manzano Marin A., Coeur d'acier A., Clamens A.-L., Orvain C., Cruaud  C., Barbe V., & Jousselin E. 2018. The coming and going of mutualistic symbionts: The ins and outs of co-obligate endosymbiont replacement in Cinara aphids. SMBE Annual Meeting. 8-12 Juillet 2018. Yokohama, Japan.

Navascués M., Becheler A., Gay L., Ronfort J., & Vitalis R. 2018. Temporal FST genome scans: the case of partially selfing populations. Sex uncovered: the evolutionary biology of reproductive systems. 23-27 April 2018. Roscoff, France.

Navascués M., Becheler A., Gay L., Ronfort J., & Vitalis R. 2018. Temporal FST genome scans: the case of partially selfing populations. Second Joint Congress on Evolutionary Biology. 19-22 Août 2018. Montpellier, France.

Olazcuaga L., Foucaud J., Rode N., Facon B., Ausset A., Leménager N., Loiseau A., Ravigné V., Gautier M., Estoup A., & Hufbauer R. A. 2018. Investigating the potential specialization of  the pest Drosophila suzukii to different host fruits. Second Joint Congress on Evolutionary Biology. 19-22 août 2018. Montpellier, France.

Olazcuaga L., Loiseau A., Rode N., Estoup A., & Gautier M. 2018. The genome response of  Drosophila suzukii  during its worldwide invasion. DrosEU/ ESEB STN Summer School on Adaptation Genomics. 23-24 août 2018. Montpellier, France.

Pavinato V., Marin J. M., & Navascués M. 2018. Detection of loci under selection from temporal population genomic data through ABC random forest. 7èmes journées scientifiques du LabEx NUMEV. 27-28 Novembre 2018. Montpellier, France.

Reynes J.-M., Carli D., Thomas D., & Castel G. 2018. Génotypes de l'orthohantavirus Puumala détectés chez l'homme en France, 2012-2016. XXes Journées Francophones de Virologie. 22-23 mars 2018. Paris, France.

Sall M., Dembele J. M., Granjon L., & Le Fur J. 2018a. A fine scale agent-based model of the nigerian gerbil () invasion in northern Senegal. Printemps de Baillarguet. 28-29 mai 2018 Montferrier sur Lez, France.

Sall M., Dembele J. M., Granjon L., & Le Fur J. 2018b. A fine scale agent-based model of the nigerian gerbil () invasion in northern Senegal. 9th edition of Models in Ecology and Evolution PhD seminar in Montpellier. 31 mai-1 juin 2018. Montpellier, France.

Stefan V. G., Escorihuela M. J., Merlin O., Chihrane J., Ghaout S., & Piou C. 2018. Using Sentinel-3 land surface temperature to derive high resolution soil moisture estimates for Desert locust management. Assemblée Générale de l'European Geosciences Union. 8-13 avril 2018. Vienne, Autriche.

Tatard C., Galan M., Cazaux B., Dubois A., Madrières S., Murri S., Vulin J., Rivals E., Marianneau P., Charbonnel N., & Castel G. 2018. Etude de l’évolution de la diversité génétique intrahôte du virus Puumala lors d’infections expérimentales. XXes Journées Francophones de Virologie. 22-23 mars 2018. Paris, France.

Virgoulay T., Collin F.-D., Dehne Garcia A., & Leblois R. 2018. Développement et optimisation d’un outil de simulation en C++ de données génomiques en populations spatialisées. JOBIM (Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques). 3-6 Juillet 2018. Marseille, France.

 

Programmes Informatiques

Cazaux B., Castel G., & Rivals E. 2018. AquaPony: visualization and interpretation of phylogeographic information on phylogenetic trees. http://www.atgc-montpellier.fr/aquapony/

 

Thèses

Dkhili J. 2018. Analyses des effets de la structure spatiale de la végétation sur les mouvements de groupes de criquets ravageurs des cultures. (PhD Thesis), Université Ibn Zohr, Agadir, Maroc.  228 pp.

Hivert V. 2018. Analyse de la différenciation génétique à l'ère des nouvelles technologies de séquençage. (PhD Thesis), Montpellier SupAgro, Montpellier, France. 146 pages + 158 pages d'Annexes.

 

Autres productions

Kergoat G. J. (2018). Participation en tant que chercheur INRA au film documentaire « Disparition des insectes, une catastrophe silencieuse ». Production : ARTE. Réalisation : Mehltretter, T. (https://www.arte.tv/fr/videos/077368-000-A/disparition-des-insectes/).

 

 

Publications 2008-juin 2013 (rapport AERES 2013)

Thèses soutenues depuis 2008-2017 et thèses en cours 2018 (voir aussi doctorants)