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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Centre de Biologie pour la Gestion des Populations - UMR Inra, IRD, Cirad, Montpellier SupAgro

Réjane Streiff

Streiff
© P. Audiot
Je m'intéresse aux bases comportementales, génomiques et épigénétiques de la spécialisation à la plante hôte chez des espèces de lépidoptères, et à l'histoire évolutive de la relation plante-insecte comme moteur de la diversification et de la spéciation.
  • PARCOURS:

2015: HDR soutenue le 22 juin 2015 à l'Université de Montpellier: "Evolution neutre et adaptative des populations naturelles; Illustration chez les pyrales du genre Ostrinia spécialisées à leurs plantes hôtes"

2013-2018: accueil au laboratoire DGIMI (UMR INRA-Université de Montpellier) dans l'équipe Epigénétique, Holocentrisme et Adaptation d'E. d'Alençon

2000-...: Chargée de Recherche (CR2 puis CR1) INRA au CBGP (Centre de Biologie pour la Gestion des Populations), sur la diversité génétique de différents espèces d'insectes en danger d'extinction ou ravageurs des cultures. Génomique de l'adaptation

1999-2000: Post-Doctorat à l'Université d'Algarve au Portugal sur l'estimation des tailles efficaces de populations de langoustines, en collaboration avec Leonor Cancela

1994-1998: Doctorat de l'Université de Montpellier 2; thèse éffectuée à l'INRA de Pierroton Cestas sur la génétique des arbres forestiers sous la direction d'Antoine Kremer

1993-1994: DEA Ecologie et Evolution de l'Université de Montpellier 2, stage effectué à l'Université de Montpellier sur l'estimation statistique du taux d'autofécondation à partir de l'analyse du coalescent, sous la direction de Monty Slatkin

1991-1994: Formation des Ingénieurs Forestiers de l'ENGREF de Nancy

  • ACTIVITÉS de RECHERCHE:

     

Les insectes phytophages sont caractérisées par leur diversité (en nombre d'espèces) et leur spécialisation à la plante hôte élevées. Le rôle de la plante hôte comme moteur de cette diversification reste encore une hypothèse, qui reste largement à étayer au niveau des mécanismes impliqués en particulier.

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Les pyrales du genre Ostrinia sont des modèles de choix pour tester cette hypothèse. En Europe on observe deux espèces du genre : la pyrale du maïs Ostrinia nubilalis (nommée également ECB pour European corn borer) et sa consoeur O. scapulalis (ABB, Adzuki bean borer) que l'on trouve sur différentes dicotylédones, dont l'armoise, le houblon et le chanvre. Nous nous intéressons à la spécialisation de ces deux espèces à leurs plantes hôtes respectives par de la biologie expérimentale (transplantation réciproque, choix de plantes, infestations contrôlées) ou génomique (RNAseq), à leur divergence par des approches de génétique des populations et de génomique, aux bases génomiques et plus largement moléculaires (épigénétiques) de leur adaptation, et enfin au lien entre adaptation et divergence.

Nous avons développé de nombreux outils génomiques (génome, transcriptomes, miRNA [Gschloessl et al. 2013, 2018, Brousseau et al. 2018, d'Alençon et al. in prep]) pour reconstruire l'histoire des populations et de l'adaptation à la plante hôte entre ces deux espèces. Nous avons pu ainsi identifier des gènes et des miRNA (régulateurs de l'expression génique) dont l'activité est liée à la fitness larvaire et au choix de plantes lors de la ponte (Orsucci et al. 2016, 2018a,b). Le criblage de variants SNPs pangénomiques en populations naturelles en cours permet d'identifier, en parallèle des études précédentes, des régions génomiques impliquées dans l'adaptation à la plante et/ou la divergence entre ABB et ECB. L'objectif de ces dernières recherches est d'apporter des validations croisées de différents gènes candidats (identifiés en populations expérimentales et naturelles de façon indépendante), et de comparer l'histoire évolutive des régions génomiques 'neutres', empreintes de la divergence entre espèces, de celles participant à l'architecture génétique de l'adaptation à la plante.

Enfin nos travaux ont ouvert la piste des communautés microbiennes comme cause ou conséquence de la divergence entre espèces. L'observation inopinée de virus et bactéries associées à ECB et ABB dans nos expériences, ainsi que l'importance de la fonction immunitaire dans la divergence entre ECB et ABB observée lors du criblage génomique des populations naturelles, nous amènent à élargir notre point de vue sur la niche écologique que représente la plant hôte et à nous intéresser à la communauté pluri-trophique impliquée: plantes-insectes-microorganismes. Pour cela nous débutons des recherches de caractérisation virale en populations naturelles et de caractérisation immunitaire en populations contrôlées.

  • PROJETS de RECHERCHE (porteur principal)

2019-2021: INRA-SPE LepiVir: Métagénomique virale et réponse immunitaire de lépidoptères ravageurs de cultures

2014-2018: ANR Adapt-Ome : Contributions du genome, du transcriptome et de l’épigénome à l’adaptation de lépidoptères (Ostrinia spp.) à leurs plantes hôtes

2013-2015: INRA-SPE.Gènes différentiellement exprimés en lien avec la plante hôte chez deux pyrales du genre Ostrinia

2011 : INRA-AIP Bio-Ressources. SCOOP (Super Contigs in Ostrinia spp. to Optimize Population survey)

2007-2009: INRA-SPE: GAPS / Genetics of Adaptation in Pest Species

2000-2004: Institut Français de la Biodiversité (IFB). Origine, originalité et risque d’extinction de Prionotropis hystrix rhodanica Uvarov, 1923 [Orthoptera, Pamphagidae], criquet endémique de la plaine de Crau (Bouches du Rhône)

1999-2003: Ministère de l’environnement et du développement durable, Programme Espaces Protégés. Fragmentation, complémentarité et fonctionnalité des espaces protégés pour la conservation des espèces : l’exemple de la Crau 

Esquer-Garrigos Y, Streiff R, Party V, Nidelet S, Navascués M, Greenfield MD (2019) Pleistocene origins of chorusing diversity in Mediterranean bush-cricket populations (Ephippiger diurnus). Biological Journal of the Linnean Society, online early

Orsucci M, Audiot P, Nidelet S, Dorkeld, F. Pommier, A. Vabre, M. Severac, D. Rohmer, M. Gschloessl, B Bourguet, D. Streiff, R (2018b) Transcriptomic response of female adult moths to host and non-host plants in two closely related species. BMC Evolutionary Biology 18:145. https://bmcevolbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12862-018-1257-3

Brousseau L, Nidelet S, Streiff R (2018) Annotation of Z-heterosomal and autosomal scaffolds of Ostrinia scapulalis nuclear genome (Lepidoptera, Crambidae) through whole-genome sequencing depth analysis. Data in Brief, 20:644-648. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352340918308618

Orsucci M, Audiot P, Dorkeld F, Pommier, A. Vabre, M. Gschloessl, B Rialle, S. Severac, D. Bourguet, D. Streiff, R (2018a). Larval transcriptomic response to host plants in two related phytophagous lepidopteran species: implications for host specialization and species divergence. BMC Genomics, 19: 265. https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-018-4589-x

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B. Gschloessl, F. Dorkeld, H. Berges, G. Beydon, O. Bouchez, M. Branco, A. Bretaudeau, C. Burban, E. Dubois, P. Gauthier, E. Lhuillier, J. Nichols, S. Nidelet, S. Rocha, L. Sauné, R. Streiff, M. Gautier, C. Kerdelhué (2018). Draft genome and reference transcriptomic resources for the urticating pine defoliator Thaumetopoea pityocampa (Lepidoptera: Notodontidae) Molecular Ecology resources. 18(3): 602-619.

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