Charbonnel Nathalie

DR2, INRA EFPA

Mes recherches ont pour thématique générale les interactions entre rongeurs et pathogènes. Elles visent à décrire ces interactions, leur variabilité dans le temps et l’espace, et à comprendre les mécanismes qui régissent leur évolution. Dans le cadre de l’étude des zoonoses liées aux rongeurs, je m'attache à caractériser les réservoirs et les agents de zoonoses, à analyser les processus macro- et microévolutifs qui façonnent la diversité des interactions réservoirs/pathogènes, et à évaluer l’impact des coinfections et des flores microbiennes sur la sensibilité des rongeurs à certains pathogènes. L’étude de la variabilité des réponses immunitaires, des points de vue génétique (immunogénétique) et ‘fonctionnelle’ (immunoécologie) est centrale dans le développement de ces axes de recherches.

Groupe thématique de rattachement : Ecologie et Evolution des Zoonoses

Voir aussi

Responsabilités collectives

Co-animatrice du groupe thématique “Ecologie et Evolution des Zoonoses” (2015-)
Co-animatrice du Plateau de Biologie moléculaire du CBGP (2016-2017)
Membre nommée de la CSS BPE de l’INRA (2013-2018)
Membre élue du conseil scientifique du département EFPA de l’INRA (2012-2015; 2016-)
Membre nommée de la CSS3 ‘Sciences des systèmes écologiques’ de l’IRD et membre de la délégation permanente (2012-2015)
Référente de l'ED GAIA pour les thèses des filières BDI et EERGP (2011-2015)

Activités éditoriales

Membre éditorial de Nature Scientific Report
Relectrice d’articles pour Evolution; Genetics; Infection, Genetics and Evolution; Journal of Animal Ecology; Molecular Ecology; Functional Ecology; Proceedings of the Royal Society...

Enseignement

Immunoécologie (Master 2, université Montpellier)
Génétique des populations (Montpellier SupAgro)

Publications récentes (depuis 2015)

Dubois A, Castel G, Murri S, Pulido C, Pons JB, Benoit L, Loiseau A, Lakhdar L, Galan M, Marianneau P, Charbonnel N (Submitted). Bank vole immunoheterogeneity may limit nephropatia epidemica emergence in a French non-endemic region. International Journal for Parasitology.

Amidi Diagne C, Charbonnel N, Henttonen H, Sironen T, Brouat C (Submitted). Serological survey of zoonotic viruses in invasive and native commensal rodents in Senegal, West Africa. Parasites & Vectors.

Amidi Diagne C, Galan M, Tamisier L, D'Ambrosio J, Dalecky A, Bâ K, Kane M, Niang Y, Diallo M, Sow A, Tatard C, Loiseau A, Fossati O, Sembene M, Cosson JF, Charbonnel N, Brouat C (submitted). Biological invasions in rodent communities: from ecological interactions to zoonotic bacterial infection issues. Nature Scientific Report.

Dubois A, Castel G, Murri S, Pulido C, Pons JB, Benoit L, Loiseau A, Lakhdar L, Galan M, Charbonnel N, Marianneau P (In press). Experimental infections of wild bank voles (Myodes glareolus) from Nephropatia Epidemica endemic and non-endemic regions revealed slight differences in Puumala virological course and immunological responses. Virus Research.

Dubois A, Galan M, Guivier E, Henttonen H, Voutilainen L, Gauffre B, Vitalis R, Cosson J-F, Charbonnel N (2017). Microevolution of bank voles (Myodes glareolus) at neutral and immune-related genes during a multi-annual complete dynamic cycle : consequences for Puumala hantavirus epidemiology. Infection Genetics and Evolution 47,318–329.

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Amidi Diagne C, Ribas Salvador A, Charbonnel N et al. (2016). Parasites and invasions: changes in gastrointestinal helminth assemblages in invasive and native rodents in Senegal. International Journal for Parasitology 46,857–869.

Amidi Diagne C, Gilot-Fromont E, Cornet S, Husse L, Doucoure A, Dalecky A, Bâ K, Kane M, Niang Y, Diallo M, Sow A, Piry S, Artige E, Brouat C, Charbonnel N (2016). Contemporary evolution of immunity in invasive house mice (Mus musculus domesticus) and black rats (Rattus rattus) in Senegal. Oikos 126,435-446.

Cornet S, Brouat C, Charbonnel N (2016). EcoImmunology and bioinvasion: revisiting the EICA hypotheses. Evolutionary applications. 9, 952-962.

Galan, M, M Razzauti, E Bard et al. (2016). 16S metagenomics for epidemiological survey of bacteria in wildlife: the importance of considering false positive and false negative samples. mSystems1,e00032-00016.

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Razzauti-Feliu M, Galan M, Bernard M, Maman S, Klopp C, Charbonnel N, Vayssier-Taussat M, Eloit M, Cosson JF (2015). Comparison of next-generation sequencing approaches surveying bacterial pathogens in wildlife. PLoS Negl Trop Dis 9 :e0003929.

Cosson JF, Galan M, Bard E, Razzauti-Feliu M, Bernard M, Morand S, Bâ K, Dalecky A, Brouat C, Charbonnel N, Vayssier-Taussat M (2015). Detection of Orientia sp. DNA in rodents from Asia, West Africa and Europe. Parasites & Vectors 8: 172.

Dalecky, A, K Bâ, S Piry et al. (2015). Range expansion of the invasive house mouse Mus musculus domesticus in Senegal, West Africa: a synthesis of trapping data over three decades, 1983-2014. Mammal Review45,176–190.

Razzauti-Feliu, M, M Galan, M Bernard et al. (2015). Comparison of next-generation sequencing approaches surveying bacterial pathogens in wildlife. PLoS neglected tropical diseases9,e0003929.

Quéméré, E, M Galan, JF Cosson et al. (2015). Immunogenetic heterogeneity in a widespread synanthropic ungulate: the European roe deer (Capreolus capreolus). Molecular Ecology24,3873–3887.