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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Centre de Biologie pour la Gestion des Populations - UMR Inra, IRD, Cirad, Montpellier SupAgro

Emmanuelle Artige

Responsable technique du plateau Collections

Artige
© Aliou Sow / IRD
Je conduis et assure le développement du plateau technique « Collections » avec pour objectif de gérer, référencer, conserver et valoriser les ressources biologiques hébergées dans l’unité.

Fonctions principales

  • Responsable de la conservation préventive et curative des collections d'arthopodes et de petits mammifères à sec et en éthanol
  • Administratrice de la base de données Arthropodes sous le progiciel BioloMICS
  • Administratrice des données de la BPM (Base de données Petits Mammifères)
  • Gestionnaire des prêts des collections de référence
  • Référente Nagoya au sein de l'unité

Communications

  • « Le protocole de Nagoya et ses conséquences», Montpellier, juillet 2016,  présentation au groupe Collections du labEx CEMEB
  •  « De la collecte aux vouchers moléculaires : gestion des collections au CBGP », séminaire organisé par le Groupe d’animation scientifique du CBGP, Monferrier-sur-Lez, 6 juin 2016
  • « Sampling to vouchering : collections management at the CBGP » - Séminaire « Genetic collections and Biodiversity Research and Conservation » organisé par l’ « Institute of Vertebrate Biology » de République Tchèque (Studenec. novembre 2015)
  •  « De la collecte sur le terrain à la base de données : les bonnes pratiques sur les collections de rongeurs au CBGP », Artige E., Duplantier J.M., Piry S., Journées annuelles du groupe Rongeurs organisées par le CBGP, 2015
  • Réalisation de 5 posters pour l’inauguration de l’extension du CBGP en 2012 en présence de Marion Guillou, alors présidente de l’INRA, du préfet et du président du Conseil régional du Languedoc Roussillon. Ces posters présentent les ressources biologiques hébergées par l’unité et différents travaux de recherche liés à celles-ci.

Administration et gestion de site web

  • Arthemis : Ecologie, identification moléculaire et systématique des arthropodes. Rasplus JY, Cruaud A., Streito JC, 2015. France : Inra, Ird, Cirad, Montpellier SupAgro - CBGP.
  • PhylAphid B@se : base de données sur l’écologie, l’identification moléculaire et la systématique des pucerons. Cœur d’Acier A., Jousselin E., 2014. France : Inra - CBGP 
  • Q-bank Arthropods : identification moléculaire des arthropodes de quarantaine européenne. Rasplus JY, Boar E., 2016. Union européenne : QBOL
  • Biofis : Ravageurs d’Europe et leurs ennemis naturels. Rasplus JY, Tixier MS, 2015. France : Agropolis Fondation - CBGP
  • Page de présentation du plateau « Collections » sur l’extranet du CBGP. France : Inra - CBGP, 2015. [consulté le 31/08/2016]

Procédures et protocoles du plateau « Collections »

  • Guides de l’adhérent et de l'utlisateur du plateau tehcnique "Collections"
  • Protocoles d'intégration des données dans les bases de données communes : données de collectes, de séquençage, photographies, de formatage, etc.

Supports de formation

  • Collections et bases de données, Artige E., Pierre E. (à paraitre en 2017). In MOOC SYSCROPARNE (Massive Open Online Course) sur la taxonomie des arthropodes et des nématodes (parasites des plantes) d’intérêt agronomique. Projet d’Agropolis Fondation
  • Formation à la gestion des données de la base Arthropodes sous BioloMICS - Cours 1 (présentation de la base, les différentes tables et leurs liens, les différents types de champs, le contenus des tables, les droits et le rôle de chacun sur la base, les requêtes, les modifications manuelles).. E. Artige. INRA - CBGP : 2015. 39p.
  • Les requêtes dans la BPM (Base Petits Mammifères). E. Artige, S. Piry. INRA- CBGP : 2016. 16p.

Publications

  • Mougin, C., Artige, E., Marchand, F., Mondy, S., Ratié, C., Sellier, N., Castagnone, P., Coeur D'Acier, A., Esmenjaud, D., Faivre-Primot, C., Granjon, L., Hamelet, V., Lange, F., Pages, S., Rimet, F., Ris, N., Salle, G. (2018). BRC4Env, a network of Biological Resource Centres for research in environmental and agricultural sciences. Environmental Science and Pollution Research. , DOI : 10.1007/s11356-018-1973-7, https://prodinra.inra.fr/record/426628
  • Artige E. (2017). Gestion d’une collection entomologique : une infrastructure dédiée au CBGP. Les Cahiers Techniques de l’Inra spécial Entomologie appliquée : 13-24. 
  • Tatard, C., Garba, M., Gauthier, P., Hima, K., ARTIGE, E., Dossou, D. K. H. J., Gagare, S., Genson, G., Truc, P., Dobigny, G. (2017). Rodent-borne Trypanosoma from cities and villages of Niger and Nigeria: A special role for the invasive genus Rattus?. Acta Tropica, 171, 151 - 158. , DOI : 10.1016/j.actatropica.2017.03.027
    https://prodinra.inra.fr/record/422053
  • Coeur d'acier A., Cruaud A., Artige E., Genson G., Clamens A.-L, Pierre E., Hudaverdian S., Simon J.-C., Jousselin E., Rasplus J.-Y. (2014). DNA barcoding and associate PhylAphidB@se website for the identification of European Aphids (Insecta: Hemiptera: Aphididae). PLoS ONE, (6): e97620. doi:10.1371/journal.pone.0097620.
  • Dalecky A., Bâ K., Piry S., Lippens C., Diagne C.A., Kane M., Sow A., Diallo M., Niang Y., Konečný A., Sarr N., Artige E., Charbonnel N., Granjon L., Duplantier J.M., Brouat C. (2015). Range expansion of the invasive house mouse Mus musculus domesticus in Senegal, West Africa: A synthesis of trapping data over three decades, 1983-2014 . Mammal Review. 45 : 176-190.
  • Artige E., référente pour les collections du CBGP dans la publication : Collections taxonomiques, collections vivantes et ressources génétiques pour la biodiversité. Montpellier (2013). dossier d’Agropolis International, numéro 17. 75p. ISSN 1628-4240 [consulté le 24/06/2016]
  • Germain J.F., Chatot C., Meusnier I., Artige E., Rasplus J.-Y. & Cruaud A. 2013. Molecular identification of Epitrix potato flea beetles (Coleoptera: Chrysomelidae) in Europe and North America. 2013. Bulletin of Entomological Research, 103, 354-362.
  • Puissant S., Cruaud A., Artige E., · [...] · Rasplus J.-Y. Using DNA Barcoding to validate a morphological key to wireworms (Coleoptera, Elateridae), pest of cereals in Western Europe. 2012. Zookeys. ,Article · Jan 2012 · ZooKeys

Participation à des programmes de recherche

Responsabilité technique en tant que Gestionnaire de la base de données Arthropodes dans : deux programmes européens (FP7, Q-Bank, Q-Collect), une ANR (Auxigene), et un projet RTRA Agropolis Fondation (Biofis).

Voir aussi

- Correspondante du groupe « Collections » du LabEx CEMEB (Laboratoire d’Excellence du Centre Méditerranéen de l'Environnement et de la Biodiversité).

- Comité de pilotage du pilier Environnement (BRC4Env), de l’infrastructure nationale de recherche RARe (Ressources Agronomiques pour la Recherche)

- Participation à des projets européens sur les collections (FP7 Q-bank, Q-Collect).