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Centre de Biologie pour la Gestion des Populations - UMR Inra, IRD, Cirad, Montpellier SupAgro

Publications

Publications 2016 (avec groupe thématique et plateau technique) (mise à jour 31/03/2017)

Publications 2015 (avec groupe thématique)

Publications 2015 laboratoire BIOPASS (Dakar)

Publications 2016 laboratoire BIOPASS (Dakar) (mise à jour 09/01/2017)

Publications 2014

Publications 2013

Publications 2008-juin 2013 (rapport AERES 2013)

Thèses soutenues depuis 2008 et thèses en cours 2017 (voir aussi doctorants)

Publications CBGP 2017 (mise à jour le 11 juillet)

(avec groupe thématique et plateau technique)

Articles de revue à comité de lecture (référencés dans le Web of Science)

Aberlenc H.P. 2017. Qu’est-ce qu’un Coléoptère ? . In: Gomy Y.G., Lemagnen R. & Poussereau J., eds. Les Coléoptères de l'île de la Réunion: Parc national de la Réunion & Éditions Orphie (sous presse) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Ali N., Tavoillot J., Besnard G., Khadari B., Dmowska E., Winiszewska G., Fossati-Gaschignard O., Aït Hamza M., El Mousadik A.E.O., A., Moukhli A., Essalouh L., El Bakkali A., Chapuis E. & Mateille T. 2017. How anthropogenic changes may affect soil-borne parasite diversity? Plant-parasitic nematode communities associated with olive trees in Morocco as a case study. BMC Ecology 17, 4 (doi: 10.1186/s12898-016-0113-9)(GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

André A., Millien V., Galan M., Ribas A. & Michaux J.R. 2017. Effects of parasite and historic driven selection on the diversity and structure of a MHC-II gene in a small mammal species (Peromyscus leucopus) undergoing range expansion. Evolutionary Ecology (http://dx.doi.org/10.1007/s10682-017-9898-z) (GT Biologie, écologie et évolution des espèces envahissantes et GT Approches moléculaires et bioinformatiques haut débit)

Bennett E.A., Champlot S., Peters J., Arbuckle B.S., Guimaraes S., Pruvost M., Bar-David S., Davis S.J.M., Gautier M., Kaczensky P., Kuehn R., Mashkour M., Morales-Muñiz A., Pucher E., Tournepiche J.F., Uerpmann H.P., Bălăşescu A., Germonpré M., Gündem C.Y., Hemami M.R., Moullé P.E., Ötzan A., Uerpmann M., Walzer C., Grange T. & Geigl E.M. 2017. Taming the late Quaternary phylogeography of the Eurasiatic wild ass through ancient and modern DNA. PLoS ONE 12 (4): e0174216 (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Blandin P., Aberlenc H.-P., Bauvet C., Bianchin N., Cockle-Bétian A., Couté A., Deso G., Duguet R., Gaymard M., Holtof J.F., Hugonnot V., Ladet A., Lagarde F., Lhermenier W., Lhomme M., Morin D., Perrette C., Richard F. & Schwaab F. 2017 (2016). L’écocomplexe de Païolive en Ardèche méridionale (France) : un pic de biodiversité du hotspot méditerranéen. The Païolive ecocomplex in southern Ardèche (France): a biodiversity peak in the Mediterranean hotspot. Oecologia Mediterranea 42 (2): 51-95 (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Boratyński Z., Brito J.C., Campos J.C., Cunha J.L., Granjon L., Mappes T., Ndiaye A., Rzebik-Kowalska B. & Serén N. 2017. Repeated evolution of camouflage in speciose desert rodents. Scientific Reports 7: 3522 (http:/:dx.doi.org/10.1038/s41598-017-03444-y) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité) (PT Biologie moléculaire et PT Collections)

Branco M., Paiva M.R., Santos H., Burban C. & Kerdelhué C. 2017. Experimental evidence for heritable reproductive time in two allochronic populations of pine processionary moth. Insect Science (sous presse) (doi:10.1111/1744-7917.12287)  (GT Adaptation des phytophages, de leurs ennemis naturels et de leurs symbiontes)

Budde K.B., González-Martínez S.C., Navascués M., Burgarella C., Mosca E., Lorenzo Z., Zabal-Aguirre M., Vendramin G.G., Verdú M., Pausas J.G. & Heuertz M. 2017. Increased fire frequency promotes stronger spatial genetic structure and natural selection at regional and local scales in Pinus halepensis Mill. Annals of Botany (sous presse) (doi: 10.1093/aob/mcw286) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Castel G., Tordo N. & Plyusnin A. 2017. Estimation of main diversification time-points of hantaviruses using phylogenetic analyses of complete genomes Virus Research 233: 60-69 (http://dx.doi.org/10.1016/j.virusres.2017.03.011)(GT Ecologie et évolution des zoonoses)

Chapuis M.P., Foucart A., Plantamp P., Blondin L., Leménager N., Benoit L., Gay P.E. & Bazelet C.S. 2017. Genetic and morphological variation in non-polyphenic southern African populations of the desert locust. African Entomology 25(1): 13-23 (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Ciabrelli F., Comoglio F., Fellous S., Bonev B., Ninova M., Szabo Q., Xuéreb A., Klopp C., Aravin A., Paro R., Bantignies F. & Cavalli G. Stable Polycomb-dependent transgenerational inheritance of chromatin states in Drosophila. Nature Genetics (online) (http://dx.doi.org/10.1038/ng.3848) (GT Adaptation des phytophages, de leurs ennemis naturels et de leurs symbiontes)

Cruaud P., Rasplus J.Y., Rodriguez L.J. & Cruaud A. 2017. High throughput sequencing of multiple amplicons for barcoding and integrative taxonomy. Scientific Reports (acceptée) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Delvare G., Heimpel G.E., Baur H., Chadee D.D., Martinez R. & Knutie S.A. Description of Brachymeria philornisae sp. n. (Hymenoptera: Chalcididae), a parasitoid of the bird parasite Philornis trinitensis (Diptera: Muscidae) in Tobago, with a review of the sibling species. Zootaxa 4242 (1): 034-060 (10.11646/zootaxa.4242.1.2) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Denux O., Dauffy-Richard E., Rossi J.P. & Augustin S. 2017. Rediscovery of the endangered species Harpalus flavescens (Coleoptera: Carabidae) in the Loire River. Insect Conservation and Diversity (sous presse) (http://dx.doi.org/10.1111/icad.12228) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Diagne C., Gilot-Fromont E., Cornet S., Husse L., Doucouré S., Dalecky A., Bâ K., Kane M., Niang Y., Diallo M., Sow A., Fossati-Gaschignard O., Piry S., Artige E., Sembène M., Brouat C. & Charbonnel N. 2017. Contemporary evolution of immunity during range expansion of two invasive rodents in Senegal. Oikos (sous presse) (http://dx.doi.org/10.1111/oik.03470) (GT Ecologie et évolution des zoonoses ; GT Biologie, écologie et évolution des espèces envahissantes)

Dobigny G., Britton-Davidian J. & Robinson T.J. 2017. Chromosomal polymorphism in mammals: an evolutionary perspective. Biological Reviews (revue hybride) (sous presse) (doi:10.1111/brv.12213) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Dos Santos V. & Tixier M.-S. 2017. Molecular markers for analysing phylogenetic relationships within the mite family Phytoseiidae (Acari: Mesostigmata) Cladistics (accepté) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Dubois A., Castel G., Murri S., Pulido C., Pons J.B., Benoit L., Loiseau A., Lakhdar L., Galan M., Charbonnel N. & Marianneau P. 2017. Experimental infections of wild bank voles (Myodes glareolus) from nephropatia epidemica endemic and non-endemic regions revealed slight differences in Puumala virological course and immunological responses. Virus Research (accepté) (http://dx.doi.org/10.1016/j.virusres.2017.04.004)(GT Ecologie et évolution des zoonoses)

Dubois A., Galan M., Guivier E., Henttonen H., Voutilainen L., Gauffre B., Vitalis R., Cosson J.F. & Charbonnel N. 2017. Microevolution of Bank voles (Myodes glareolus) at Neutral and Immune-Related Genes During a Multi-Annual Complete Dynamic Cycle : consequences for Puumala hantavirus epidemiology. Infection Genetics and Evolution 49: 318-329 (doi:10.1016/j.meegid.2016.12.007) (GT Ecologie et évolution des zoonoses + PT BM + PT Bio INFO)

Farache F.H.A., Cruaud A., Genson G., Rasplus J.-Y. & Pereira R.A.S. 2017. Taxonomic revision and molecular phylogenetics of the Idarnes incertus species group (Hymenoptera, Agaonidae, Sycophaginae) PeerJ 5: e2842 (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

FAW Consortium. 2017 ([ce consortium regroupe 65 chercheurs inclus G. Kergoat et S. Nidelet). 2017. Two genomes of highly polyphagous lepidopteran pests (Spodoptera frugiperda, Noctuidae) with different host-plant ranges. Scientific Reports (accepté) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Fraimout A., Debat V., Fellous S., Hufbauer R., Foucaud J., Pudlo P., Marin J.M., Price D.K., Cattel J., Chen X., Depra M., Duyck P.F., Guedot C., Kenis M., Kimura M.T., Loeb G., Loiseau A., Martinez-Sanudo I., Pascual M., Richmond M.P., Shearer P., Singh N., Ytamura K., Xuéreb A., Zhang J. & Estoup A. 2017. Deciphering the Routes of invasion of Drosophila suzukii by Means of ABC Random Forest. Molecular Biology and Evolution (http://dx.doi.org/10.1093/molbev/msx050) (GT Biologie, écologie et évolution des espèces envahissantes)

Gautier M., Klassmann A. & Vitalis R. 2017. REHH 2.0: a reimplementation of the R package REHH to detect positive selection from haplotype structure. Molecular Ecology Resources 17: 78-90 (10.1111/1755-0998.12634) (GT Génomique statistique et évolutive des populations)

Gay P.-E., Lecoq M. & Piou C. 2017. Improving preventive locust management: insights from a multi-agent model. Pest Management Science (accepté) (http://dx.doi.org/10.1002/ps.4648) (GT Biologie, écologie et évolution des espèces envahissantes)

Gibon F.M. 2017. The Chimarra lehibemavo species-group, new and endemic to Madagascar (Trichoptera, Philopotamidae). European Journal of taxonomy 319: 1-31 (http://dx.doi.org/10.5852/ejt.2017.319) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Godefroid M., Rasplus J.Y. & Rossi J.P. 2017. Accounting for phylogeography in species distribution modeling: A case study with Dendroctonus bark beetles. Ecography (acceptée) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Hudson L. N., Newbold T., Contu S., Hill S. L. L., Lysenko I., De Palma A., ... Granjon L.,...  Purvis A. (515 signataires). 2017. The database of the PREDICTS (Projecting Responses of Ecological Diversity In Changing Terrestrial Systems) project. Ecology and Evolution 7: 145–188.  (doi:10.1002/ece3.2579) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Kergoat G.J., Meseguer A.S. & Jousselin E. 2017. Evolution of plant-insect interactions: insights from macroevolutionary approaches in plants and herbivorous insects. Advances in Botanical Research 81: 25-53 (doi:10.1016/bs.abr.2016.09.005) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité  ; GT Adaptation des phytophages, de leurs ennemis naturels et de leurs symbiontes)

Le Gall L., Delsuc F., Hourdez S., Lecointre G. & Rasplus J.Y. 2017. Toward the DNA library of life. European Journal of Taxonomy 266: 1-9 (doi:10.5852/ejt.2017.266) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Le Ru B., Capdevielle-Dulac C., Musyoka B.K., Pallangyo B., Njaku M., Goftishu M., Assefa Y., Sezonlin M., Ong’Amo G. & Kergoat G.J. 2017. Phylogeny and systematics of the Acrapex apicestriata (Bethune-Baker) species complex (Lepidoptera, Noctuidae, Noctuinae, Apameini) with the description of eight new species from the Afrotropics. Annales de la Société Entomologique de France (NS) (accepté) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Le Ru B., Capdevielle-Dulac C., Musyoka B.K., Goftishu M., Assefa Y., Ndemah R., Molo R., Chipabika G., Conlong D., Ong’Amo G. & Kergoat G.J. 2017. Molecular phylogenetics and definition of the Acrapex minima Janse group (Lepidoptera, Noctuidae, Apameini, Sesamiina) with the description of four new species from the Afrotropics. Annales de la Société Entomologique de France (NS): sous presse (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Manfio D., Jorge I.R., Kergoat G.J. & Ribeiro-Costa C.S. 2017. Morphology-based phylogeny of the genus Ctenocolum Kingsolver & Whitehead (Coleoptera, Chrysomelidae, Bruchinae), with descriptions of three new species. Insect Systematics and Evolution (accepté) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Marchal L., Cazères S., Kergoat G.J., Letellier K., Mitchell A., Nattier R. & Mille C. 2017. A new pest of lychees in New Caledonia. New Zealand Journal of Zoology (sous presse) (doi:10.1080/03014223.2016.1250787) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Meseguer A., Manzano-Marin A., Coeur d'acier A., Clamens A.L., Godefroid M. & Jousselin, E. 2017. Buchnera has changed flatmate but the repeated replacement of co-obligate symbionts is not associated with the ecological expansions of their aphid hosts. Molecular Ecology (sous presse) (doi:10.1111/mec.13910) (GT Adaptation des phytophages, de leurs ennemis naturels et de leurs symbiontes)

Meynard C.N., Gay P.E., Lecoq M., Foucart A., Piou C. & Chapuis M.P. 2017. Climate-driven geographicdistribution of the desert locust during recession periods : Subspecies’ niche differentiation and relative risks under scenarios of climate change. Global Change Biology (accepté) (http://dx.doi.org/10.1111/gcb.13739) (GT Biologie, écologie et évolution des espèces envahissantes)

Michel B., Clamens A.L., Bethoux O., Kergoat G.J. & Condamine F.L. 2017. A first time-calibrated phylogeny of antlions (Neuroptera: Myrmeleontidae). Molecular Phylogenetics and Evolution (accepté) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Mouttet R., Streito J.C., Genson G. & Germain J.F. 2017. Molecular evidence supports the recognition of Epitrix papa as a distinct species from Epitrix similaris. Bulletin OEPP/EPPO Bulletin (sous presse)(GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Orsucci M., Navajas M. & Fellous S. 2017. Genotype-specific interactions between parasitic arthropods. Heredity (accepté) (doi:10.1038/hdy.2016.90) (GT Adaptation des phytophages, de leurs ennemis naturels et de leurs symbiontes)

Petrucco-Toffolo E., Basso A., Kerdelhué C., Ipekdal K., Mendel Z., Simonato M. & Battisti A. 2017. Evidence of potential hybridization in the Thaumetopoea pityocampa-wilkinsoni complex. Agricultural and Forest Entomology (sous presse) (http://dx.doi.org/10.1111/afe.12224) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Plantamp P., Estragnat V., Fellous S., Desouhant E. & Gibert P. 2017. Where and what to feed? Differential effects on fecundity and longevity in the invasive Drosophila suzukii. Basic and Applied Ecology  19: 56-66 (http://dx.doi.org/10.1016/j.baae.2016.10.005) (GT Biologie, écologie et évolution des espèces envahissantes)

Popkin M., Piffaretti J., Clamens A.L., Qiao G.X., Chen J., Vitalis R., Vanlerberghe-Masutti F., Gupta R.K., Lamaari M., Langella O., Coeur d'acier A. & Jousselin E. 2017. Large-scale phylogeographic study of the cosmopolitan aphid pest Brachycaudus helichrysi reveals host plant associated lineages that evolved in allopatry Biological Journal of the Linnean Society (sous presse) (online: 7 SEP 2016) (doi:10.1111/bij.12869) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité ; GT Adaptation des phytophages, de leurs ennemis naturels et de leurs symbiontes ; PT BM)

Ratnadass A., Randriamanantsoa R., Aberlenc H.P., Rafamatanantsoa E., Rajaonera T.E. & Letourmy P. 2017. Impacts of some cropping systems on the abundance of soilborne insect pests and damage to upland rice. Applied Soil Ecology (sous presse) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Rocha S., Kerdelhué C., Ben Jamaa M.L., Dhahri S., Burban C. & Branco M. 2017. Effect of heat waves on embryo mortality in the pine processionary moth. Bulletin of Entomological Research (sous presse) (10.1017/S0007485317000104) (GT Adaptation des phytophages, de leurs ennemis naturels et de leurs symbiontes)

Rodriguez L.J., Young F., Rasplus J.Y., Kjellberg  F. & Compton S.G. 2017. Constraints on convergence: Hydrophobic hind legs allow some male pollinator fig wasps early access to submerged females. Journal of Natural History (acceptée) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Roman-Ruiz A.K., Michel B., Dufour B.P., Rojas J.C., Cruz-Lopez L. & Barrera J.F. 2017. Description of the sperm and spermatheca of Hypothenemus hampei (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae) for the differentiation of mated and unmated females. Annals of the Entomological Society of America (sous presse) (http://dx.doi.org/10.1093/aesa/sax033) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Rombaut A., Guilhot R., Xuéreb A., Benoit L., Chapuis M.P., Gibert P. & Fellous S. 2017. Invasive Drosophila suzukii facilitates Drosophila melanogaster infestation and sour rot outbreaks in the vineyards. Royal Society Open Science 4: 170117 (http://dx.doi.org/10.1098/rsos.170117) (GT Biologie, écologie et évolution des espèces envahissantes)

Rossi J.-P., Imbault V., Lamant T. & Rousselet J. 2017. An inventory of coniferous urban trees in the city of Orléans (France) Data in Brief (sous presse) (doi:10.1016/j.dib.2016.10.015) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Sereno D., Akhoundi M., Dorkeld F., Oury B., Momen H. & Perrin P. 2017. What pre-Columbian mummies could teach us about South American leishmaniases ?  Pathogens and Disease (accepté) (http://dx.doi.org/10.1093/femspd/ftx019) (GT Approches moléculaires et bioinformatiques haut débit)

Soldati L., Condamine F.L., Clamens A.L. & Kergoat G.J. 2017. Documenting tenebrionid diversity: progress on Blaps Fabricius (Coleoptera, Tenebrionidae, Tenebrioninae, Blaptini) systematics, with the description of five new species. European Journal of Taxonomy (accepté) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité ;  PT Collections ; PT Biologie Moléculaire ; PT informatique)

Soldati L., Condamine F.L., Clamens A.L., Mogia M. & Kergoat G.J. 2017. The Tenebrionidae (Insecta, Coleoptera) of Mount Wilhelm and Wanang, with description of a new species and a preliminary phylogeny of Stenochiinae. Mémoires du Muséum national d'Histoire naturelle 209: 1-31 (GT Origine et caractérisation de la biodiversité ; PT Collections ; PT Biologie moléculaire ; PT Informatique)

Streito J.C., Clouet C., Hamdi F. & Gauthier N. 2017. Population genetic structure of Macrolophus pygmaeus in Mediterranean agroecosystems. Insect Science (sous presse) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Tatard C., Garba M., Gauthier P., Hima K., Artige E., Dossou D.K.H.J., Gagaré S., Genson G., Truc P. & Dobigny G. 2017. Rodent-borne Trypanosoma from cities and villages of Niger and Nigeria: a special role for the invasive genus Rattus? Acta Tropica (sous presse) (GT Ecologie et évolution des zoonoses)

Tixier M.S., Dos Santos Vicente V., Douin M., Duso C. & Kreiter S. 2017. Great molecular variation within the species Phytoseius finitimus (Acari: Phytoseiidae): implications for diagnosis decision within the mite family Phytoseiidae. Acarologia (online first) (http://dx.doi.org/10.24349/acarologia/20174168) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Vicente N., Kergoat G.J., Dong J., Yotoko K., Legendre F., Nattier R. & Robillard T. 2017. In and out of the Neotropics: Historical biogeography of Eneopterinae crickets. Journal of Biogeography (accepté) (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

 
Articles de revue sans comité de lecture ou non répertoriés dans le WoS

Germain J.F., Lemmet S., Balmès V. & Streito J.C. 2017. Incursion d’un nouvel aleurode nuisible aux ficus en France. Phytoma 705: 9-11 (GT Origine et caractérisation de la biodiversité)

Ouvrages et chapitres d'ouvrage

Delvare G. 2017. Order Hymenoptera family Chalcididae.  Arthropod Fauna of the UAE volume 6, Abu Dhabi: Dar Al Ummah, pp. 225-274.

Estoup A., Verdu P., Marin J.M., Pudlo P., Dehne-Garcia A. & Robert C.P. 2017. Application of approximate Bayesian computation to infer the genetic history of Pygmy hunter-gatherers populations from Western Central Africa. In: Sisson S., Fan Y. & Beaumont M., eds. Approximate Bayesian Computation: CRC press Taylor & Francis group (sous presse)

Marin J.M., Pudlo P., Estoup A. & Robert C.P. 2017. Likelihood-free model choice In: Sisson S., Fan Y. & Beaumont M., eds. Approximate Bayesian Computation: CRC press Taylor & Francis group (sous presse).

Conférences invitées
Communications publiées
Communications orales
Thèses et HDR

Mboup P.A. 2017. Un meta-modèle multi-monde et multi-échelle pour la simulation à base d’agents de systèmes complexes présentant des phénomènes historiques et géographiques : Application à l’étude de la diffusion du rat noir au Sénégal. Doctorat en Informatique. Dakar: Université Cheick Anta Diop. 147 pp.

Vicente V. 2017. Étude des relations phylogénétiques entre les genres de Phytoseiidae (Acari : Mesostigmata) et implications pour la lutte biologique. Thèse, Montpellier: Montpellier SupAgro, 28 avril.

Autres productions