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Centre de Biologie pour la Gestion des Populations - UMR Inra, IRD, Cirad, Montpellier SupAgro

Clamens

Clamens
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Je suis technicienne en biologie moléculaire.

Je travaille avec Gael Kergoat et Emmanuelle Jousselin, deux chercheurs du CBGP respectivement SPE et EFPA.

Je travaille également avec Armelle Coeur d'Acier (Ingénieur de recherche, taxonomiste des pucerons), mais aussi Bruno Michel (Entomologiste CIRAD).

Je travaille principalement sur modèle insecte (coléoptères, papillons, pucerons, névroptères).

Depuis 2 ans, j'utilise les technologies Illumina pour développer des protocoles de séquençage haut débit pour :

(1) séquencer le 16S bactérien pour trouver les endosymbiontes des pucerons (pour confirmer la présence de Wolbachia ou Serratia).

(2) séquencer le génome de Buchnera (endosymbionte obligatoire) grâce au kit Nextera XT. Pour cela, j'ai expérimenté un protocole de filtration de pucerons pour garder seulement les petites cellules de la taille de bactéries.

(3) obtenir un micro-barcode (500pb, du gène COI) à partir de pucerons récoltés en champs ou dans des parcs nationaux ; pour réaliser une identification d'espèces de pucerons accessible à tous les non-spécialistes. Ceci est possible grâce à un blast sur la base de données COI de pucerons (développée par Armelle Coeur d'Acier) qui contient les références de COI pour la plupart des espèces européennes de pucerons.

Cette année, je suis en mission longue durée au Canada, à l'Université d'Alberta dans le laboratoire de Felix Sperling.

Je développe le kit Nextera sur NextSeq pour séquencer le génome de plusieurs papillons (Papilionidae). Ces données vont nous aider à construire des phylogénies fortes et soutenues.